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温州医科大学开设的专业有：生物医学工程、眼视光医学(5+3)一体化、眼视光医学、眼视光医学（新医科班）、生物医学工程（眼视光工程新工科班）、英语、精神医学、应用心理学、放射医学、市场营销、劳动与社会保障、预防医学、公共事业管理、基础医学、法医学、口腔医学、临床医学（5+3一体化，麻醉学方向）、临床医学（5+3一体化，儿科学方向）、康复治疗学、临床医学（5+3一体化）、儿科学、麻醉学、中医学、临床医学、临床医学（中外合作办学）、临床医学（检验医师培养试验班）、生物技术、医学检验技术、卫生检验与检疫、临床医学(留学生)、医学影像学、口腔医学(留学生)、药学(留学生)、护理学(留学生)、助产学、护理学、生物制药、药学、临床药学、中药学、临床医学、医学影像学。
国家级级特色专业：4个：药学、医学检验技术、临床医学、眼视光医学。
省级(直辖市)级特色专业：11个：临床医学、医学检验技术、药学、护理学、口腔医学、生物医学工程、麻醉学、预防医学、应用心理学、康复治疗学、中药学。
省重点、培育专业级特色专业：10个：临床医学、眼视光学、医学检验技术、护理学、麻醉学、药学、生物技术、生物医学工程、预防医学、医学影像学。
温州医科大学是浙江省省属普通高等学校。学校可溯源至创办于1912年的浙江医学专门学校，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后以校址所在地定名为“温州医学院”，2013年更名为“温州医科大学”，2015年成为浙江省政府、国家卫生健康委和教育部共建高校。2017年，成为浙江省重点建设高校。
学校1958年开始招收五年制本科学生，1978年招收硕士研究生，是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有临床医学、基础医学、药学、生物医学工程、医学技术一级学科博士点和临床医学专业学位博士点，临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、医学技术、口腔医学、公共卫生与预防医学、公共管理等12个一级学科硕士点，临床医学、生物医学工程、口腔医学、护理、药学、公共卫生、应用心理等7个专业硕士学位授权点；设有临床医学和药学一级学科博士后科研流动站。学校位列ESI全国高校综合排名第73位，临床医学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、材料科学、化学、神经科学与行为学、免疫学8个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学专业进入ESI全球排名前1.21‰。拥有1个省部共建国家重点实验室、1个国家工程技术研究中心、1 个国家临床医学研究中心（眼科疾病）、1个国家药监局眼科疾病医疗器械和药物临床研究与评价重点实验室、2个教育部省部共建协同创新中心、2个国家国际科技合作基地、29个省部级科研平台。2个浙江省“重中之重一级学科”，3个浙江省A类一流学科、6个B类一流学科，10个浙江省高校重点学科，2个浙江省重点建设学科。
