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亳州学院开设的专业有：经济与金融、酒店管理、物流管理、音乐学、运动康复、体育教育、商务英语、英语、环境设计、产品设计、酿酒工程、食品科学与工程、生物工程、数据科学与大数据技术、电气工程与智能控制、电子商务、应用统计学、电子信息工程、汉语言文学、网络与新媒体、文化产业管理、小学教育、学前教育、制药工程、中药学、药物分析、药学。
省级(直辖市)级特色专业：3个：旅游服务与管理、物流管理、学前教育。
亳州学院是国家教育部批准设置的公办普通本科高校，坐落于“国家历史文化名城”、全国“四大药都”之首——安徽亳州。这里文脉悠长，人文荟萃，老子、庄子、曹操、华佗、花木兰、陈抟等一批圣哲先贤诞生于此，具有3700多年历史的亳州成为彪炳史册、泽被中华的道家文化、中医药文化的发祥地。
学校大力弘扬和传承优秀传统文化，凸显文化的育人功能。积极打造“亳文化”特色品牌，组建中医药文化研究、老庄道学研究、曹魏与建安文化研究、华佗传统体育养生、方言民俗文化调查研究5个研究团队；编撰《亳州通史》，出版专著《薛蕙校注编年》，持续加强“亳文化”的影响力。
