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皖南医学院开设的专业有：制药工程、药物制剂、药学、中药学、临床药学、口腔医学、公共事业管理（卫生事业管理方向）、应用心理学、法学、保险学、麻醉学、食品卫生与营养学、预防医学、护理学、助产学、信息管理与信息系统、医学信息工程、智能医学工程、临床医学、康复治疗学、法医学、医学影像技术、医学影像学、生物医学工程、卫生检验与检疫、医学检验技术。
国家级级特色专业：1个：法医学。
省级(直辖市)级特色专业：9个：法学、护理学、医学检验技术、医学影像学、临床医学、口腔医学、法医学、预防医学、麻醉学。
皖南医学院地处素有“长江巨埠、皖之中坚”之称的历史名城——芜湖市，濒临浩瀚长江，汇集江南神秀。学校建于1958年，时为芜湖医学专科学校；1971年并入安徽医学院，为安徽医学院皖南分院；1974年经国务院批准独立建校，命名为皖南医学院；1981年学校获得国务院学位委员会学士学位和硕士学位授予权；1998年一次性通过教育部本科教学工作合格评价；2008年顺利通过教育部本科教学工作水平评估并获优秀等级；2018年顺利通过教育部本科教学工作审核评估。2019年，学校成为安徽省博士学位授权立项建设单位。2020年通过临床医学专业认证，有效期六年。
学校注重教学科研团队和平台建设，现有国家级虚拟仿真实验教学项目1 个、省级虚拟仿真实验教学项目15个、省级人才培养模式创新实验区1 个、省级教学团队16个、课程思政教学团队2个，省级卓越人才教育培养计划7 项、省级“六卓越、一拔尖”卓越人才培养创新项目6个、省级精品类课程41 门、省级一流课程25门，省级智慧课堂（含试点项目）12门、省级示范实验实训中心7个；有10个省级科研平台：安徽省多糖药物工程技术研究中心、活性生物大分子研究安徽省重点实验室、大学生心理健康教育研究中心安徽省人文社科重点研究基地、重大疾病非编码RNA转化研究安徽省普通高校重点实验室、安徽省皖南地区植物药活性筛选与再评价工程实验室、老年疾病国家临床医学研究中心安徽分中心、安徽省危重症（呼吸疾病）临床医学研究中心、中药药理三级实验室、安徽省药物临床评价中心、国家药物临床试验机构。公开出版《皖南医学院学报》《中国临床药理学与治疗学》2种学术期刊。图书馆馆藏纸质图书98.6万册、电子图书430万册、中外文报刊1116种。
